服务介绍:
miRNA引物设计是针对成熟序列设计的茎环引物,长度大约45bp,可以自身成环。在3’-端序列的反向互补序列引入一段固定的序列形成一个茎环,即为逆转录引物;在序列的5’-端引入一段固定的序列,即为扩增引物的上游序列。
实验结果展示:
1、引物设计
2、引物示例
实验流程:
设计引物-合成引物
使用方法:
miRNA-茎环法-逆转录引物(*****-RT)稀释方法:
1.引物附在离心管内壁上,稀释前请将引物离心数秒使干粉聚集至管底,小心开启管盖,以免引起粉末飞扬造成损失;
2.将所有逆转录引物(-RT,以及U6-A)稀释成100μM:按照管壁上的nmol数加入10倍体积的无酶水(Water Nuclease-Free,Servicebio,货号:G4700);
3.以上稀释引物各取1μL(-RT,以及U6-A)加入到一个新的无菌无酶离心管,用无酶水补齐到100ul,混合均匀,即为Gene Specific Primer (1 μM);
逆转录操作步骤(参考)
以SweScript RT II First Strand cDNA Synthesis Kit (With gDNA Remover)(Servicebio, G3333)为例:
1. 基因组去除:配制基因组去除反应体系(推荐10 μL):
10×gDNA Remover Buffer | 1 μL |
gDNA Remover | 1 μL |
Total RNA/mRNA | 0.1 ng-5 μg/10 pg-0.5 μg |
Nuclease-Free Water | Add to 10 μL |
2. 第一链cDNA合成
(1) 逆转录反应体系配制(推荐20 μL反应体系):
基因组去除反应液 | 10 μL |
5×Reaction Buffer | 4 μL |
Gene Specific Primer (1 μM) | 2 μL |
SweScript RT II Enzyme Mix | 1 μL |
Nuclease Free Water | Add to 20 μL |
轻轻混匀并离心;
(2) 逆转录程序设置:
25℃ | 5 min |
55℃ | 5-15 min |
85℃ | 5 s |
送样运输要求:
基因名称和种属、或基因ID号、或成熟的RNA序列;成熟的miRNA有3p和5p之分,故需要告知设计3p还是5p,可以参考相关文献。
仅供科研用途,不可用于临床诊断!