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CRISPR大鼠基因敲除模型构建:技术流程、应用与皮诺飞生物解决方案


1.引言

CRISPR-Cas9技术因其高效、精准的基因编辑能力,已成为构建大鼠基因敲除(KO)模型的首选方法。相较于传统方法(如ES细胞打靶),CRISPR技术周期短、成本低,适用于大规模基因功能研究。皮诺飞生物基于多年CRISPR大鼠模型构建经验,提供从sgRNA设计到表型分析的一站式服务,成功构建超过500种基因敲除大鼠模型,广泛应用于疾病机制研究、药物开发和功能基因组学。

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皮诺飞生物动物模型实验室CRISPR大鼠模型构建

本文将系统介绍CRISPR大鼠基因敲除模型的构建流程、关键优化点、常见问题及解决方案,并结合皮诺飞生物的特色服务,为研究者提供标准化操作指南。


2.CRISPR大鼠基因敲除模型构建流程

 

2.1靶点设计与sgRNA优化

(1)基因结构分析

-确定目标基因的外显子区域(优先选择首个功能域或关键外显子)

-避免脱靶效应:使用CRISPRscan、CHOPCHOP等工具预测sgRNA效率

-皮诺飞生物提供AI辅助sgRNA设计服务,脱靶率<0.1%

 

(2)sgRNA合成与验证

|步骤|关键参数|

|sgRNA合成|化学修饰(2'-O-methyl增强稳定性)|

|体外验证|T7E1酶切或Sanger测序检测切割效率|

|优化方案|若效率<60%,需重新设计sgRNA|

 

2.2胚胎显微注射与基因编辑

(1)受精卵准备

-选用SD或Wistar大鼠(6-8周龄,SPF级)

-超排卵处理(PMSG+hCG方案)

 

(2)CRISPR组分注射

-注射方案:

 -Cas9mRNA+sgRNA(常用,减少脱靶风险)

 -RNP(核糖核蛋白复合物)(编辑效率更高)

-显微注射参数:

 -注射体积:1-2pL/胚胎

 -Cas9浓度:50-100ng/μL

 

(3)胚胎移植

-注射后胚胎培养至2-细胞期

-移植至假孕母鼠(移植存活率>80%)

 

2.3基因型鉴定与建系

(1)初筛(F0代)

-PCR+测序检测突变类型(Indel、大片段缺失等)

-TIDE分析计算编辑效率

 

(2)稳定品系建立(F1代)

-筛选杂合子(+/-)进行互配

-Southernblot或长片段PCR验证纯合子(-/-)

 

3.关键优化点与常见问题

 

3.1提高编辑效率的策略

|影响因素|优化方案|

|---------|---------|

|sgRNA设计|选择高GC含量(40-60%)区域|

|Cas9递送方式|RNP比质粒更高效|

|胚胎质量|使用新鲜受精卵(<2h内注射)|

 

3.2常见问题与解决方案

|问题|可能原因|解决方案|

|------|---------|---------|

|低编辑效率|sgRNA设计不佳|重新优化sgRNA|

|高嵌合率(F0)|注射时间延迟|使用早期胚胎(原核期)|

|脱靶效应|sgRNA特异性低|选择高评分sgRNA或使用HiFiCas9|

 

4.皮诺飞生物特色服务

 

4.1一站式CRISPR大鼠模型构建

-从设计到表型分析全程服务

-3个月快速交付(传统方法需6-12个月)

 

4.2基因编辑质控体系

|检测项目|方法|

|---------|------|

|脱靶分析|全基因组测序(WGS)|

|表型验证|WB/qPCR/免疫组化|

 

4.3典型应用案例

-案例1:构建ApoE敲除大鼠(动脉粥样硬化研究)

-案例2:IL-10KO大鼠(炎症性肠病模型)

 

5.结论

CRISPR技术极大促进了大鼠基因敲除模型的构建效率,但仍需优化sgRNA设计、胚胎操作和基因型鉴定等关键步骤。皮诺飞生物提供高成功率、低脱靶率的CRISPR大鼠模型构建服务,助力基因功能研究与药物开发。

 

如需获取详细技术方案或案例数据,请联系皮诺飞生物技术团队!www.pinuofei.com 15392937510。